SARS-CoV-2 — возбудитель COVID-19¶

SARS-CoV-2 — оболочечный РНК-содержащий вирус семейства Coronaviridae, рода Betacoronavirus, являющийся возбудителем инфекционного заболевания COVID-19. Относится к группе так называемых коронавирусов, к которой также принадлежат вирусы SARS-CoV (возбудитель атипичной пневмонии 2002–2003 годов) и MERS-CoV (возбудитель ближневосточного респираторного синдрома). Геном вируса представлен одноцепочечной РНК положительной полярности длиной около 30 тысяч нуклеотидов — одной из крупнейших среди известных РНК-вирусов.

¶Происхождение и открытие

Первые случаи пневмонии неизвестной этиологии были зарегистрированы в декабре 2019 года в городе Ухань (провинция Хубэй, Китай). 31 декабря 2019 года Всемирная организация здравоохранения (ВОЗ) получила уведомление о вспышке. 7 января 2020 года китайские исследователи выделили и секвенировали новый вирус, а 11 февраля 2020 года Международный комитет по таксономии вирусов присвоил ему название SARS-CoV-2. 11 марта 2020 года ВОЗ объявила вспышку пандемией.

Ближайшими известными родственниками вируса считаются коронавирусы летучих мышей (например, штамм RaTG13, схожий примерно на 96 %), что указывает на зоонозное происхождение. Точный промежуточный хозяин, если он существовал, не установлен; в качестве вероятных кандидатов рассматривались панголины. Вопрос о естественном или лабораторном происхождении вируса остаётся предметом дискуссий и не имеет консенсусного научного решения.

¶Структура и геном

Вирион имеет сферическую форму диаметром около 60–140 нм. Основные структурные белки:

• S (spike) — шиповидный белок, обеспечивающий связывание с рецептором ACE2 клетки-хозяина и проникновение в неё; главная мишень нейтрализующих антител и вакцин.
• N (nucleocapsid) — нуклеокапсидный белок, связывающий РНК.
• M (membrane) и E (envelope) — мембранные белки, формирующие оболочку.
• Неструктурные белки (NSP1–NSP16) обеспечивают репликацию и уклонение от иммунного ответа.

Ключевой особенностью является мутационная изменчивость, приводящая к появлению новых вариантов.

¶Варианты

ВОЗ использовала систему обозначений греческими буквами для вариантов, представляющих интерес:

Линия Омикрон и её сублинии (BA.1–BA.5, XBB, позднее JN.1 и другие) доминировали в глобальной циркуляции с конца 2021 года.

¶Пути передачи и патогенез

Основной путь передачи — воздушно-капельный и аэрозольный, реже — контактный. Вирус проникает в клетки эпителия дыхательных путей, связываясь с рецептором ACE2. Инкубационный период составляет в среднем 2–7 суток. Клиническая картина варьирует от бессимптомного носительства до тяжёлой пневмонии, острого респираторного дистресс-синдрома и полиорганных нарушений. Факторами риска тяжёлого течения являются пожилой возраст, ожирение, сахарный диабет, сердечно-сосудистые и иммунодефицитные состояния.

¶Диагностика, профилактика и лечение

Лабораторная диагностика основана на методе полимеразной цепной реакции с обратной транскрипцией (ОТ-ПЦР), а также на экспресс-тестах на антигены и серологических исследованиях.

Профилактика включает вакцинацию (мРНК-вакцины, векторные, инактивированные и белковые препараты), ношение масок, гигиену рук и социальное дистанцирование. Для лечения применялись противовирусные средства (ремесдевир, нирматрелвир/ритонавир), моноклональные антитела и иммуномодуляторы (кортикостероиды при тяжёлом течении). Пандемия COVID-19 стала крупнейшим санитарным кризисом XXI века и стимулировала беспрецедентное по скорости развитие вакцинных платформ.